Чтобы определить, в каких предложениях расставлены знаки препинания неправильно, нужно проанализировать каждое из них по правилам русского языка.
    - Предложение А: "Он вдруг услышал эту тишину и понял, что это и есть тишина, и что она совсем не означает отсутствия звуков." 
        
            - Здесь запятая перед "что" ставится правильно, так как это придаточное предложение.
- Запятая перед "и что" также правильная, так как соединяет две части сложносочиненного предложения.
 Предложение А правильно оформлено. 
- Предложение Б: "И ему стало вдруг грустно от сознания, что если пройдёт миг и всё это исчезнет, то исчезнет навсегда."
        
            - Запятая перед "что" ставится правильно.
- Запятая перед "и всё это исчезнет" не нужна, так как "если пройдёт миг и всё это исчезнет" является единым придаточным предложением.
 В предложении Б есть ошибка в расстановке запятой. 
- Предложение В: "Тот кто считает возвращение в родные края вопросом лишь воли, тоже нередко ощущает приступы тоски по родине."
        
            - Запятая перед "кто" отсутствует, хотя она должна быть, так как "кто считает" - это придаточное предложение.
 В предложении В есть ошибка в оформлении запятой. 
- Предложение Г: "Утром я почувствовал, что и океан, и небо, и степь, и скала, над которой кружили чайки, - всё чужое."
        
            - Запятая перед "и" ставится правильно, так как это сложносочиненное предложение.
- Запятая перед "над которой" также правильная.
 Предложение Г оформлено правильно. 
- Предложение Д: "Идут обыденные дожди, по собственным лужам скользя, как будто они поклялись идти, а клятву нарушить нельзя."
        
            - Запятая перед "как будто" ставится правильно, так как это вводное предложение.
- Запятая перед "а" также оформлена правильно.
 Предложение Д оформлено правильно. 
Вывод: Ошибки в расстановке знаков препинания есть в предложениях Б и В.